來源:原理
大約20億年前,當多細胞生物出現(xiàn)的那一刻起,癌癥也出現(xiàn)了。
正如癌癥演化學家雅典娜·阿克蒂皮斯在《狡猾的細胞》中所寫的,“癌癥并不是通常意義上我們所說的敵人。它并非一支行動有序、整齊劃一的軍隊,團結(jié)一致,欲置我們于死地而后快。相反,它只是一群無組織無紀律、各不相同的細胞,面對治療會做出各種各樣的反應(yīng)”。
在很多情況下,癌癥最致命的風險往往不是來自原發(fā)腫瘤,而是癌癥的擴散。一些惡性腫瘤細胞會脫離最初發(fā)病的部位,通過各種方式到達身體的其他組織和器官,然后繼續(xù)生長,形成新的腫瘤,這一過程被稱為轉(zhuǎn)移。轉(zhuǎn)移在癌癥患者身上并不罕見,但它卻是目前癌癥生物學中最不被了解的方面之一。
在一項新的研究中,一組科學家通過新型的技術(shù)追蹤轉(zhuǎn)移細胞的發(fā)展,讓我們對這個過程的認識邁進了一大步。他們在細胞中發(fā)現(xiàn)了一種“侵略性譜”的模式,一些細胞更傾向于在原發(fā)腫瘤的部位“保持原位”,而另一些細胞更有可能到達身體新的部位,侵占其他組織或器官。
研究結(jié)果表明,不僅是基因突變促使了癌癥的擴散,單細胞RNA分析的結(jié)果強調(diào)了基因表達模式,也就是細胞開啟或關(guān)閉哪些基因,也會在疾病結(jié)果中起著關(guān)鍵作用。研究已于近日發(fā)表在《癌細胞》上。
雖然科學家已經(jīng)描述了數(shù)百種與促使正常細胞癌變相關(guān)的基因突變,但他們對能使癌細胞轉(zhuǎn)移的突變的認識卻非常有限。
有人認為,一種可能性是,轉(zhuǎn)移這一過程還依賴于突變之外的其他因素,又或者,它是太多異常組合出現(xiàn)的結(jié)果,因此很難確定其特征。
為了更好地理解伴隨轉(zhuǎn)移發(fā)生的生物學變化,在新研究中,團隊計劃通過“演化條形碼”(它更專業(yè)的名字是CRISPR譜系追蹤)技術(shù),來細致地追蹤這個過程。
研究人員開發(fā)了一種新的方法,利用CRISPR/Cas9來誘變引入的合成DNA序列,它們就好像細胞“貼”上的條形碼。
隨后,這些經(jīng)過改造的癌細胞被注入兩只實驗小鼠的胰腺,讓其在體內(nèi)發(fā)生轉(zhuǎn)移。當癌癥在宿主小鼠體內(nèi)發(fā)展和擴散時,細胞條形碼會被CRISPR/Cas9隨機“編輯”。由此產(chǎn)生的編輯模式就可以用來重建癌細胞在全身擴散和轉(zhuǎn)移時的系統(tǒng)發(fā)育樹。
這一技術(shù)能幫助他們觀察到以前無法獲得的新信息。他們將這種新技術(shù)和單細胞RNA測序結(jié)合,根據(jù)細胞的轉(zhuǎn)移程度對它們進行排序,然后將這些行為差異與基因表達的變化聯(lián)系起來。
通過觀察兩只實驗小鼠的多個器官中約28000個癌細胞,研究人員能夠看到當癌細胞從胰腺擴散到其他器官和組織時,每個細胞都開啟了哪些基因。他們還追蹤了細胞在體內(nèi)擴散的情況,從而確定某些細胞譜系,也就是同一個“細胞大家庭”,是否比其他譜系更容易發(fā)生轉(zhuǎn)移。
換句話說,對所有這些細胞,科學家現(xiàn)在知道它們在體內(nèi)的位置,他們還掌握了一種衡量它們轉(zhuǎn)移情況的指標,同時,他們也有細胞的轉(zhuǎn)錄物組的信息,或者可以理解成細胞的RNA分子目錄。
當團隊一同檢查這些數(shù)據(jù)時,他們驚訝地發(fā)現(xiàn),大約一半的克隆(可以理解成不同癌細胞群)僅僅限于原發(fā)腫瘤的范圍內(nèi)。而當他們觀察已經(jīng)擴散的細胞克隆時,發(fā)現(xiàn)每只小鼠只有一種明顯占優(yōu)勢的克隆。這和科學家原本的預(yù)想非常不一樣。
這種占據(jù)優(yōu)勢的克隆的轉(zhuǎn)錄物組譜,和其他擴散的克隆,以及與局限于原發(fā)腫瘤的克隆都不同。這個最具侵略性克隆的基因表達數(shù)據(jù)顯示,它啟動了與上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)換(EMT)相關(guān)的基因,而EMT這一過程恰恰被認為賦予了癌癥一些具有侵略性的特點。
在整個克隆中,研究團隊發(fā)現(xiàn),如果把細胞的EMT狀態(tài)繪制成一張連續(xù)譜,從表達許多上皮基因,到表達許多間充質(zhì)基因,那么細胞會在這張譜中占據(jù)不同的位置。
團隊注意到,更具侵略性的細胞的基因圖譜中出現(xiàn)了許多與人類癌癥相關(guān)的基因,其中一些基因已經(jīng)被預(yù)測與生存率的降低有關(guān)。
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他們還發(fā)現(xiàn),在第二只小鼠體內(nèi)一種格外具有侵略性的克隆中,一個與癌癥特性相關(guān)的基因家族與其他克隆相比出現(xiàn)了顯著的過度表達。這個基因家族的表達或許能以某種方式增強轉(zhuǎn)移的能力。
在未來的工作中,團隊希望進一步研究轉(zhuǎn)移過程,同時也探索應(yīng)用這種譜系追蹤工具的新途徑,比如研究發(fā)育過程、干細胞生物學或者一些組織器官的再生。
他們希望這種新的方法能夠更好地帶領(lǐng)人們探索甚至回答那些以前無法解決的問題。
#創(chuàng)作團隊:
文字:M?ka
#參考來源:
https://penntoday.upenn.edu/news/pinpointing-how-cancer-cells-turn-aggressive
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1535610821002713?via%3Dihub
[美] 雅典娜·阿克蒂皮斯,《狡猾的細胞》,中信出版·鸚鵡螺,2021年6月
#圖片來源:
封面來源:Kamen Simeonov / UPenn
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